Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mesp1P97309 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms