Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gabpb2P81069 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms