Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx3P81067 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx3P81067 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Irx3P81067 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx3P81067 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms