Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cct4P80315 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cct4P80315 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms