Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otx1P80205 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otx1P80205 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms