Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dlx4P70436 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dlx4P70436 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms