Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tubb4bP68372 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms