Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrx1P63013 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx1P63013 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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