Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2bP62915 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2bP62915 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms