Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lsm5P62322 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lsm5P62322 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms