Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snrpd2P62317 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms