Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps11P62281 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms