Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg6P61406 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smg6P61406 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smg6P61406 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms