Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arf3P61205 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Arf3P61205 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf3P61205 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms