Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Actr1aP61164 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Actr1aP61164 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms