Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ActbP60710 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ActbP60710 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ActbP60710 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ActbP60710 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ActbP60710 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ActbP60710 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ActbP60710 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms