Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arpc4P59999 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arpc4P59999 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms