Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm2P58774 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpm2P58774 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms