Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Paxbp1P58501 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms