Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Samsn1P57725 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms