Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bace1P56818 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bace1P56818 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bace1P56818 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms