Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf5P56477 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf5P56477 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms