Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gp1bbP56400 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gp1bbP56400 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms