Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Aqp4P55088 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aqp4P55088 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms