Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Faf1P54731 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Faf1P54731 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms