Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fgf9P54130 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf9P54130 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf9P54130 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms