Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms