Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ClgnP52194 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ClgnP52194 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClgnP52194 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms