Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
XpcP51612 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
XpcP51612 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XpcP51612 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XpcP51612 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XpcP51612 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XpcP51612 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XpcP51612 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XpcP51612 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XpcP51612 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XpcP51612 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms