Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Hoxc13P50207 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc13P50207 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc13P50207 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc13P50207 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc13P50207 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms