Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna7P49582 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms