Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epb42P49222 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epb42P49222 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms