Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ptx3P48759 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms