Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Abcd1P48410 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms