Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rfx1P48377 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfx1P48377 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms