Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gbx2P48031 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms