Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrprbP47758 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrprbP47758 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms