Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gdf5P43027 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gdf5P43027 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms