Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3rP40223 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms