Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Grik2P39087 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Grik2P39087 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms