Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Flt1P35969 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Flt1P35969 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Flt1P35969 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Flt1P35969 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Flt1P35969 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Flt1P35969 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Flt1P35969 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Flt1P35969 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Flt1P35969 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms