Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc5P35689 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc5P35689 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms