Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pola2P33611 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pola2P33611 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pola2P33611 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pola2P33611 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms