Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf8P32972 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfsf8P32972 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms