Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SsbP32067 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SsbP32067 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SsbP32067 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SsbP32067 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SsbP32067 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SsbP32067 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SsbP32067 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SsbP32067 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SsbP32067 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SsbP32067 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SsbP32067 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SsbP32067 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SsbP32067 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms