Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gsx2P31316 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms