Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gsx1P31315 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gsx1P31315 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms