Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd28P31041 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms