Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vcam1P29533 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vcam1P29533 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vcam1P29533 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms