Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IppP28575 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IppP28575 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IppP28575 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IppP28575 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IppP28575 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IppP28575 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IppP28575 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IppP28575 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IppP28575 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IppP28575 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IppP28575 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IppP28575 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms